Het hoofdpersonage van de rockopera is de "Jesus of Suburbia" , die zijn dorp verlaat en naar de stad verhuist. Eén theorie is dat hij na zijn verhuis van identiteit verandert en zijn naam verandert in 'Saint Jimmy'. Anderen denken dat hij schizofreen is. Een andere theorie is dat hij zich bij een groep aansluit die opgericht is door Saint Jimmy. Tijdens de laatste helft van het verhaal (dat iets meer dan een jaar duurt), wordt Jesus of Suburbia verliefd op een naamloos personage, die hij beschrijft als een buitenbeentje, een rebel. Op het einde van het verhaal is Jesus of Suburbia verward omdat Saint Jimmy zelfmoord gepleegd heeft. Of hij zich nu losgemaakt heeft van dat personage, of dat Saint Jimmy een echte persoon was die zelfmoord pleegde, is onduidelijk. De naamloze persoon, die nu wordt vernoemd als "Whatsername" (watishaarnaam; omdat hij het vergeten is, of nooit heeft geweten), verlaat Jesus of Suburbia. Een andere opvatting is dat het personage Saint Jimmy een kwaadaardige kant is van Jesus of Suburbia en niet een karakter in zichzelf. De tekening op het album van American Idiot verwijst naar de zin in "She's a Rebel", nl. "And she's holding on my heart like a hand grenade!" (En ze houdt mijn hart vast als een handgranaat).
Lang leve Wikipedia!